و ينص القانون على أن الأزهر يشمل الهيئات الآتية:

1- المجلس الأعلى للأزهر

و هو الهيئة التي تختص بالتوجيه و رسم السياسة العامة لكل ما يحقق أغراض الأزهر في سبيل خدمة الفكرة الإسلامية الشاملة. و يرأس هذا المجلس شيخ الأزهر و يضم أعضاء من كبار العلماء المتخصصين.

2- مجمع البحوث الاسلامية

و هو الهيئة العليا للبحوث الإسلامية. و يقوم بدراسة كل ما يتصل بهذه البحوث. و يعمل على تحديد الثقافة الإسلامية و تنقيتها من الشوائب، و الكشف عن جوهرها الأصيل. و العمل على نشر الدعوة الاسلامية.

و تنظيم بعوث الأزهر إلى العالم الإسلامي، و من العالم الاسلامي. و يتكون المجمع من خمسين عضوا من كبار علماء الإسلام، يمثلون جميع المذاهب الإسلامية، و يكون من بينهم عدد لا يزيد عن العشرين من غير مواطني جمهورية مصر العربية و يرأس المجمع شيخ الأزهر. و يكون نصف أعضائه على الاقل متفرغين لعضويته.

3- ادارة الثقافة و البعوث الاسلامية

و هي الجهاز الذي يهيي‌ء لمجمع البحوث الإسلامية كل أسباب البحث و الدراسة. و بختص بكل ما يتصل بالنشر و الترجمة و العلاقات الإسلامية من البعوث و الدعاة و استقبال طلاب المنح.

4- جامعة الأزهر

و تختص بكل ما يتعلق بالتعليم العالي في الأزهر. كما تهتم ببعث التراث العلمي و الفكري و الروحي للشعوب الاسلامية و العربية. و إعداد بعض العاملين الذين يجمعون إلى جانب التفقه في العقيدة و الشريعة و لغة القرآن، كفاية علمية و مهنية تؤهلهم للاشتراك في كل أنواع النشاط و الدعوة إلى سبيل الله بالحكمة و الموعظة الحسنة. و تضم الجامعة كليات‌