ثم انفصلت عنها العلوم الرياضية فسائر العلوم الأخرى، و اقتصرت في دراساتها على الموضوعات التالية:
-المعرفة.
-الوجود.
-القيم الثلاث (الحق و الخير و الجمال) .
و العلم الذي اختص بدراسة الحق هو علم المنطق، و الذي اختص بدراسة الخير هو علم الأخلاق، و بالجمال هو علم الجمال أو الفن.
و كان علم المنطق يمثل منهج التفكير حيث يعنى بدراسة قواعد التعريف و قواعد الإستدلال و قواعد تنظيم العلوم، التي استقلت-هذه الأخيرة-فيما بعد باسم (مناهج البحث) .
فمناهج البحث التي ولدت في أحضان الفلسفة كانت فرعا من المنطق.
و لأن الفلسفة تقوم على أساس من التفكير العقلي، و يتوصل إلى نظرياتها و آرائها عن طريقه كان منهجها المنطقي عقليا أيضا.
فكانت الفكر المرحلي الذي تمخض عن المنهج العقلي.
و أخيرا، استقل علم المنطق عن الدرس الفلسفي، و كذلك استقل علم الأخلاق عنها، و تبعهما في ذلك علم الجمال، فأصبح كل واحد من هؤلاء الثلاثة علما مستقلا بذاته.
و اختصت الفلسفة بدراسة (المعرفة) و (الوجود) .
ثم و بعد ذلك انفصلت الدراسات المتأخرة بما يعرف بنظرية المعرفة.
و اقتصرت الفلسفة على دراسة (ما بعد الطبيعة) أو ما يعرف بـ (الميتافيزيقا