وقد ترك سيدنا الجليل آثاراً وتآليف عديدة تصل إلى 86 كتاباً أو موسوعة أو رسالة، وإليك بعض ما ألّف في الفقه وأُصوله:

1. الذريعة في أُصول الفقه في جزءين.

2. مسائل المفردات في أُصول الفقه.

3. مسائل الخلاف في أُصول الفقه.

هذا ما ألّفه في الاَُصول؛ وأمّا في الفقه، فقد ألّف الكتب التالية:

1. إبطال القول بالعدد.

2. مسائل الخلاف في الفقه.

3. الناصرية في الفقه ،وهي عبارة عن 207 مسائل استلّها الشريف المرتضى من فقه الناصر الكبير (جدّه لاَُمّه) وشرحها وصحّحها، واستدل على صحتها من الكتاب والسنّة والاِجماع.

4. الديلمية في الفقه.

5. الرد على أصحاب العدد في شهر رمضان.

6. المصباح في الفقه. [1]

إلى غير ذلك من المسائل التي ألّفها في جواب الاَسئلة والاستفسارات التي كانت ترد إليه من نواحي شتّى.وكفى في فضله انّ المعرّي لمّا خرج من العراق سئل عن السيد المرتضى، فقال:

يا سائلي عنه لما جئت تسأله * ألا هو الرجل العاري من العار
لو جئته لرأيت الناس في رجل * والدهر في ساعة والاَرض في دار [2]