و بما أن ملوك البلاد الإسلامية لم يرسلوا خلال هذه الفترة منبرا ليوضع فى مسجد المدينة فبنى سكان دار السكينة فى مكان ما من المسجد منبرا من اللبن ظانين أنه محل المنبر القديم و جصصوا داخله و خارجه و ذلك فى سنة 886 ه و أخذ خطباء مسجد السعادة يخطبون فوق هذا المنبر، و بعد سنتين هدم هذا المنبر و قلع من مكانه و ركز مكانه المنبر الذى أرسله «قايتباى» المصرى و بهذا تغير مكان المنبر الذى صنع فى عصر السعادة؛ لأن السلطان قايتباى المصرى كان قد صنع منبرا حجريا و أرسله، و ذلك فى سنة (888) ه و قرر هدم المنبر الذى صنعه أهالى المدينة المنورة فى خلال شهر رجب الفرد من نفس العام، و حفروا الأساس ليوضع مكانه المنبر الجديد و لم يجدوا حيث حفروا أساس المنبر القديم فتركوا هذا المكان و حفروا مكانا آخر؛ و ظهرت بقية أساس المنبر القديم فى الجهة الشرقية من المكان المحفور للمرة الثانية، إلا أن القائمين لم يطمئنوا أن هذا المكان هو مكان الأساس القديم فتركوه و أمروا بحفر مكان آخر إلا أن علائم الأساس القديم لم تظهر فى هذا المكان أيضا، و على هذا أصر شمس الدين بن زين متعمدا على أن يوضع المنبر حيث حفر أول مرة أى فى المكان الذى بنى فيه أهل المدينة المنبر الترابى قبل سنتين مع أن أهل المدينة لم يفكروا فى التحرى عن أساس المنبر القديم كما أنهم لم يحاولوا بناء منبرهم على أساس المنبر القديم.

و قد أتى الإمام السمهودى بأدلة واضحة على أن المكان الذى حفر للمرة الثانية حيث وجدت بقايا الأساس القديم أنه المكان الذى وضع فيه باقوم النجار أساس المنبر الذى صنعه فى عصر السعادة، و بين أن المنبر الذى أرسله السلطان قايتباى المصرى يجب أن يوضع فوق تلك الحفرة و كسب فى هذا الصدد كثيرا من المؤيدين له من العلماء إلا أن «شمس الدين بن زين» أصر على فكرته و تنفيذ رأيه الفج، و ادعى أن أهل المدينة حينما بنوا منبرهم فى سنة 886 ه بالتخمين بنوه على أساس المنبر القديم، و على هذا يجب أن يوضع هذا المنبر فوق أساس منبر أهل المدينة و لن أتنازل عن هذا، و ابتدأ فى تنفيذ رأيه و أمر بردم الحفرة التى أشار إليها الإمام السمهودى و ركز المنبر فى المكان الذى حفر أولا ثم ترك بناء على‌