صنف الشيخ الاعظم آثاره فى مواضيع ثلاثة نذكر اسمائها مع شرح مختصر فى كل واحد منها.
الاوّل- اصول الفقه
1- كتاب اصول الفقه:
لعل اوّل من اشار اليه تلميذه الكبير الشيخ محمد حسن المامقانى فى مقدمة «غاية الآمال» كما مر، و بعده صاحب «معارف الرجال» [1] ثم رأى نسخته صاحب «الذريعة» و قال: انه فى مجلد ضخم محتو على اثنين و ستين مبحثا من الاصول الفقهية فى مباحث الالفاظ و الادلة العقلية جميعا رأيت النسخة المنتسخة عن خط المصنف فى خزانة آية الله المجدد الشيرازى» [2] لم يطبع الكتاب و لم ينقل منه شيء فى ساير المصادر.
2- حاشية على «قوانين الاصول المحكمة»:
كتاب «القوانين» للفقيه الاصولى الكبير الميرزا ابى القاسم الجيلانى القمى و ايام دراسة الكتاب كتب الشيخ الاعظم عليه حواش متفرقة، يقول صاحب الذريعة: «قال سيدنا الحسن صدر الدين فى «التكملة» رأيت نسخة خطه و هى من اول حجة الخبر الى تمام الادلة العقلية و كان الرسائل منتزعة منها» [3] و هذا ليس بصحيح لان كتاب «الرسائل» اى «فرائد الاصول» كما سيأتى ليس حاشية بل له اسلوب و نسق خاص. لعل هذا من حواش الفها فى اوان امره و ليس لها اهمية كبرى.