نفائس المخطوطات فی هذه المکتبة:

(فی علم الحدیث): «مشارق الأنوار» للصغانی. «الحلیة» لأبی نعیم فی ثلاثة أجزاء. «الحلیة الصغیرة» لأبی نعیم فی جزئین. «العمدة» للإمام المقدسی فی جزء.
«سیرة ابن سید الناس» فی جزء. «مجمع الزوائد و منبع الفوائد» فی جزء.
(فی علم الفقه): «مجمع البحرین» فی ثلاثة أجزاء. «الوافی» للإمام النسفی.
«کتاب الخراج» لأبی یوسف.
(فی الفقه الشافعی): «کتاب التمهید» للأسنوی. «رحمة الأمة فی اختلاف الأئمة» للقرشی.
(فی التصوف): «عوارف المعارف» للإمام السهروردی. «المیزانیة الخضریة الموضحة لجمیع الفرق الإسلامیة».
(فی التاریخ و الأدب): «طبقات الشافعیة للأسنوی». «طبقات الأولیاء» للسخاوی. «شرح قصیدة عبد اللّه الحجازی» للشیخ شعیب الکیالی. «المختار من نوارد الأخیار» للمقری. «روض الأنس» للنیسابوری. «سبائک الذهب فی أنساب العرب». «تراجم الأدباء». «الأنس الجلیل فی تاریخ القدس و الخلیل».