كلمات الشيخ علي المذكور في العلوم المتفرقة التي هي بمنزلة الألغاز 20 شرح كلمات المذكور في العقل وما يقابله 21 و 22 رسالتان في بيان علم الحروف والجفر وأنحاء البسط والتكسير ومعرفة ميزان الحروف 23 جواب سؤال بعض العارفين أن المصلي حين يقول إياك نعبد وإياك نستعين كيف يقصد المخاطب وبيان أن المخاطب ذاته الأقدس لا غير 24 رسالة في البدا واحكام اللوحين لوح المحو والاثبات واللوح المحفوظ 25 تفسير سورة التوحيد وآية النور 26 كيفية السير والسلوك الموصلين إلى درجات القرب والزلفى 27 جواب المسائل التوبلية التي سأله عنها الشيخ عبد علي التوبلي وهو كبير جدا متضمن لتطبيق الباطن مع الظاهر وتحقيق القول بالانسان الكبير والصغير وبيان كثير من مراتب العرفان والرد على فرق الصوفية الباطلة وبيان الطريقة الحقة والكشف عن العوالم الخمسة وتفسير الحروف المقطعة في فواتح السور وغير ذلك من معضلات الكتاب والسنة 28 حديث النفس إلى حضرة القدس في المعارف الخمس 29 كتاب الجنة والنار 30 حجية الاجماع وحجية أحكامه السبعة وحجية الشهرة 31 اسرار الصلاة 32 مختصر في الدعاء 33 شرح مبحث حكم ذي الرأسين من كشف الغطاء ذكر فيه أحكامه من أول الطهارة إلى الديات 34 رسالة الشاه 35 الرسالة الحيدرية في الفروع الفقهية 36 مختصر منها في الطهارة والصلاة 37 المسائل القطيفية 38 الرسالة الصومية ألفها بالتماس محمد علي ميرزا 39 رسالة في أصول الدين بالفارسية 40 ديوان شعر 41 مسالة القدر وكشف السر فيه 42 شرح رسالة القدر للسيد الشريف رادا عليه 43 شرح حديث حدوث الأشياء 44 بيان الأوعية الثلاثة السرمد والدهر والزمان وبيان اللوح المحفوظ ولوح المحو والاثبات واليد والقضاء والقدر وعالم الذر والطبيعة السعيدة والشقية جوابا لسؤال السيد أبي القاسم اللاهجي 45 بيان معنى الحقيقة المحمدية 46 شرح حديث كميل في بيان الحقيقة وبيان الفرق بين القلب والعقل والصدر والنفس والوهم والفكر والخيال 47 تحقيق القول في المعاني المصدرية والمفاهيم الاعتبارية 48 أحوال البرزخ والمعاد جوابا لأسئلة ملا حسين الكرماني 49 في معنى إنا لله وإنا إليه راجعون وما في النبوي اللهم أرني الأشياء كما هي 50 بيان أحوال أهل العرفان والصوفية وطرائقهم وطرق الرياضات 51 رسالة في التجويد 52 رسالة في علم كتابة القرآن 53 الهمم العليا في جواب مسائل الرؤيا 54 تحقيق قضية موسى مع الحضر واجساد أهل الرجعة 55 شرح حديث خلق الذر والهباء 56 معنى العلم نقطة كثرها الجاهلون ومعنى حديث أن السنة 360 يوما اختزلت منها ستة أيام وحديث أن المؤمن إنما يحس بألم النار إذا خرج منها 57 حقيقة الرؤيا وأقسامها 58 معنى الكشف وكيفيته ومعنى سبق رحمة الله غضبه 59 معنى الكفر والايمان 60 معنى الفناء بالله والبقاء بالله من كلام ملا محسن الكاشي 61 جواب مسالة بعض العارفين في أن بإزاء كل خلق من المخلوقات اسما خاصا لله سبحانه بل هو المؤثر في خلقه وايجاده 62 فوائد جليلة من أمهات المعارف الإلهية 63 الوجودات الثلاثة الوجود الحق والوجود المطلق والوجود المقيد 64 شرح قول أمير المؤمنين ع أن العرش قد خلقه الله من أربعة أنوار وأحاديث الطينة وحديث أن الشمس جزء من سبعين جزءا من أنوار الكرسي 65 مسائل من اسرار القدر ومنتهى الإرادة وتحقيق أن السعيد سعيد في بطن أمه والشقي شقي في بطن أمه 66 معرفة النفس 67 تنعم وتالم أهل الآخرة 68 جواب سؤال الشيخ محمد كاظم عن تقليد مجتهدين في مسالة واحدة مع اختلافهما 69 جواب سؤال المتورع الأواه الشيخ عبد الله ابن الشيخ مبارك القطيفي 70 شرح رسالة العلم لملا محسن الكاشي والرد عليه 71 شرح حديث حدوث الأسماء المذكور في الكافي أوله أن الله خلق اسما بالحروف غير مصوت الخ 72 شرح حديث رأس الجالوت في مسائله للرضا ع 73 تحقيق أن لله تعالى علمين 74 بيان حال السقط من المؤمنين هل ينمو بعد الموت وأحواله في البرزخ والقيامة 75 أجوبة مسائل الحاج محمد طاهر القزويني 76 أجوبة مسائل متفرقة فقهية 77 رسالة في أن الخلق نهر مستدير يذهب منه أشياء تعود إليه 78 أجوبة مسائل ميرزا محمد علي بن محمد نبي خان في المشيئة 79 رسالة في أن المؤمن أفضل من الملائكة وتفسير آية سنقرئك فلا تنسى وبيان أن الجنة مكلفة أم لا 80 أجوبة مسائل الشيخ أحمد بن صالح بن طوق عن مسائل فقهية وبيان الربط بين الحادث والقديم 81 جواب مسائل محمد علي ميرزا عن العصمة والرجعة 82 جواب مسائل محمود ميرزا في الرسالة الخاقانية 83 شرح رسالة العسكري ع المرسلة إلى أهل الأهواز في مسالة الامر بين الأمرين 84 أجوبة أسئلة الشيخ أحمد بن طوق في علوم متفرقة 85 جواب مسائل الشيخ محمد القطيفي فتأويل الأبحر السبعة 86 رسالة في علم النجوم 87 جواب السؤال عن معنى الجسدين والجسمين 88 جواب السؤال عن معنى استغفار الأنبياء والأوصياء 89 رسالة في أن الشيطان لا يمكن أن يتمثل بصورة الأنبياء والأولياء 90 جواب السؤال عن معنى قوله تعالى: مثل الذين ينفقون أموالهم في سبيل الله الآية، 91 جواب أسئلة الشيخ مسعود ابن الشيخ سعود منها النبوي أنا والساعة كهاتين وأشار بالسبابة والوسطى 92 بيان حقيقة الكاف في قوله تعالى ليس كمثله شئ هل هي زائدة أو أصلية 93 جواب السؤال عمن ادعى رؤية صاحب الزمان في الجزيرة الخضراء 94 رسالة في أن القرآن أفضل أم الكعبة 95 الرسالة السراجية في الشعلة المرئية من السراج 96 معنى ثم دنى فتدلى فكان قاب قوسين أو أدنى 97 الجمع بين الأخبار الدالة على أن الأنبياء والأولياء لا يبقون في قبورهم زيادة على ثلاثة أيام وما دل على نقل نوح عظام آدم وموسى عظام يوسف 98 جواب أسئلة ملا مهدي الاسترآبادي عن أحاديث مشكلة وعلوم شتى 99 جواب أسئلة ملا حسين البافقي عن أحاديث مشكلة وفنون شتى 100 جواب أسئلة ميرزا محمد علي المدرس في المبدأ والمشتق وشرح حديث ورق الآس 101 بيان نكات دقيقة في سورة هل أتى وشرح بعض مقامات شهادة الحسين ع وبيان ما هو البكاء عليه 102 جواب السؤال عن علة حذف الياء بغير جازم في قوله تعالى والليل إذا يسر والجمع بين قوله تعالى كل شئ هالك إلا وجهه وقوله ع ما خلقتم للفناء وإنما خلقتم للبقاء إلى غير ذلك. وجل تلك المسائل من لزوم ما لا يلزم وتكلف ما لم يكلف وأغلبها تدل على ميله إلى التعمق في الأمور والخروج عن الظواهر.
أولاده كان له ولدان فاضلان أحدهما يسمى محمدا والآخر عليا وكان محمد ينكر على أبيه طريقته أشد الإنكار نظير ما يحكى عن الميرزا إبراهيم بن ملا صدرا من انكاره على أبيه. ومر الترديد في نسبته بين المطيري والمطيرفي ثم