بالنجف (١٢٩٦) والمدفون في مقبرته الكبيرة الواقعة على يسار من يمر على السكة الحديدية من أوائل وادى السلام إلى جانب الكوفة وهي حاشية على الفوائد الخمس الرجالية المصدرة بها تعليقة الوحيد. وقد كتبها بخطه على هوامش نسخه اشتراها من الشيخ محمد الخزاعي النجفي. وإمضائه في آخر كل حاشية ( علي الرازي ) رأيت هذا النسخة في مكتبة الشيخ هادي كاشف الغطاء. ورأيت نسخه من التعليقة البهبهانية بخط المولى باقر التستري المتوفى بالنجف (١٣٢٧) وقد كتب على هوامشها حواشي أستاذه الخليلي هذا. ولعله كتبها لنفسه أوان تلمذه عليه في علم الرجال ، كما كتب عليها أيضا حواش كثيره من نفسه. ورأيت قطعة من حاشية الخليلي هذا مدونة بخط تلميذ المولى علي وهو السيد مرتضى الخلخالي كتبها في النجف (١٢١٤) وهذه القطعة موجودة في كتب سادة آل خراسان في النجف.

( ١٩١ : الحاشية عليها ) أيضا على الفوائد الخمس المبدوة بها التعليقة. وهي للحاج المولى باقر بن غلام علي التستري المتوفى في (١٣٢٧) كتب التعليقة البهبهانية بخطه وقرأ الفوائد الخمس المصدر بها التعليقة على شيخه وشيخ كثير من مشايخنا الحاج المولى علي الخليلي فكتب بخطه الجيد بعض ما استفاده من شيخه المذكور على هوامش النسخة التي رأيتها عند بعض أحفاده كما أنه كتب على نسخته تمام حاشية شيخه الخليلي على التعليقة البهبهانية.

( ١٩٢ : الحاشية عليها ) أيضا على الفوائد الخمس الرجالية المصدرة بها التعليقة ، وهي لشيخنا العلامة الفقيه الرجالي الشيخ علي بن الحسين الخاقاني النجفي الشهير بالخيقاني المتوفى مناهزا للثمانين في ( ٢٦ رجب ١٣٣٤ ) حضر بحث الشيخ الأنصاري سنين وحضر في حياته وبعد وفاته بحث السيد الشيرازي في النجف إلى أن هاجر إلى سامراء فحضر بحث الشيخ راضي والحاج مولى علي الخليلي ، ثم الشيخ محمد حسين الكاظمي وبرهة في كربلاء تلمذ على الشيخ زين الدين المازندراني وبأمره كتب جملة من الرسائل الفقهية ، حدثني هو بجميع مشايخه ، ورأيت كافة تصانيفه ومنها هذا الحاشية وهي في مجلد ضخم كبير شرح فيه الفوائد الخمس الرجالية مفصلا بعنوان التعليق والحاشية ، وزاد عليها