وفي حياته العلميّة سلّطتُ الضوء على بعض المجالات التي كان للكركي دور فعّال فيها، فتحدّثتُ عن عصره ومعاصريه، وأساتذته وشيوخه، والروايات التي حصل عليها والتي منحها، ومؤلّفاته، والكتب التي قرأها والتي قُرئت عليه، ومكانته العلميّة، ونشاطه العلميّ، والمحاورات والردود العلميّة التي جرت بينه وبين بعض الأعلام، وقد احتلّ هذا القسم المجلّدين الأوّل والثاني من هذه الموسوعة.

الثاني: استخراج آرائه ونظرياته المودعة في مؤلّفاته والتي لم يُفرد لها تصنيفاً مستقلاّ، حيث أجريتُ عمليّة استقصاء كاملة لكافّة مؤلّفاته واستخرجتُ منها هذه الآراء والنظريات، وهي: آراؤه الكلاميّة، والاُصوليّة، والرجاليّة، وفوائده التأريخيّة، وملاحظاته عن بعض الكتب، وشواهده الشعريّة، والجداول والرسوم التي استعملها، وقد احتلّ هذا القسم المجلّد الثالث من هذه الموسوعة.

الثالث: تحقيق كلّ ما وصل إلينا من مؤلّفاته ـ عدا جامع المقاصد ـ سواء الصغيرة منها المتمثّلة بالرسائل والأجوبة على الأسئلة والاستفتاءات الواردة عليه من مختلف البلدان الإسلامية، أم الكبيرة المتمثّلة بشروحه وحواشيه على اُمّهات الكتب الفقهيّة المعتمدة عند علمائنا، كشرائع الإسلام والمختصر النافع للمحقّق الحلّي، والقواعد والإرشاد والمختلف للعلاّمة الحلّي، والألفيّة للشهيد الأوّل.

وقد استطعتُ بفضل الله تعالى من تحقيق أربعة وخمسين مؤلَّفاً، معتمداً على مائة وعشرين نسخة خطيّة، جمعتها من سبع مخافظات في إيران هي: قم المقدّسة، مشهد المقدّسة، طهران، همدان، يزد، خوانسار، أصفهان. وقد احتلّ هذا القسم ثمانية أجزاء من هذه الموسوعة، ابتداءً من الجزء الرابع وانتهاءً بالجزء الحادي عشر.

أمّا الجزء الثاني عشر فقد خصّصناه للفهارس العامّة.