نظرا لاهمية كتاب المعارج العلمية العلمية النابعة من مكانة مؤلفه المرموقة بين أهل العلم ، فان له نسخا كثيرة عند طلاب العلم ورواده ، بحيث يعسر مقارنتها أجمع لذا فاني اكتفيت بمقلة أربع منها ، ومن خلالها يحصل الاطمئنان باصابة عبارة المصنف. وهذه النسخ هي :

١ ـ نسخة خطية في مكتبة السيد الحكيم العامة في النجف الاشرف برقم (٣٧١) وقد نقلت إليها من مكتبة المرحوم الشيخ محمد السماوي وعليها ختمه المؤرخ (١٣٥٤) ه‌ مواصقاتها : عدد أوراقها (٥٧) بقياس (١٧ في ١٢) سم عدد الاسطر (١٩) يحتوي السطر الواحد على (١٠ ـ ١٤) كلمة تقريبا وكتيت العناوين فيها باللون الاحمر وعليها بعض الحواشي ، ناسخها ( محمد مقيم ) ظاهرا نسخها بتاريخ (١١١٧) ه‌ ، وهي قليلة السقط والاخطاء وفيها زيادات على بقية النسخ وهي مكتوبة بالفارسي وكثيرا ما أهمل الناسخ وضع النقاط على الحرفين الياء والتاء وغيرهما وبالاخص ما كان منهما في أول الكلمة.

٢ ـ نسخة خطية في مكتبة آل كاشف العظاء في النجف الاشرف برقم (٣٩٢) تقع في (٤٧) ورقة قياس (٢١ في ١٥) سم تحتوي الصفحة الواحدة على (١٧) سطرا