و ذكر صاحب الروضات أسماء تآليفه الفقهية بالنحو التالي:

1.«الهادي إلى سبيل الرشاد في شرح الاِرشاد».

2. «نفحات الفوائد ومفردات الزوائد».

3. رسالة في أحكام الرضاع.

4. رسالة في محرّمات الذبيحة.

5. رسالة في الصوم ينقل عنه الاَردبيلي في «مجمع الفائدة».

6. رسالة في أحكام الشكوك.

7. شرحه على ألفية الشهيد.

8. تعليقات كثيرة على الشرائع. [1]

ومن المسائل التي خالف فيها المحقّق الكركي هو مسألة حل الخراج، ففي الواقع كان المحقّق الكركي يوَيد الحكومة الصفوية لا سيما الشاه طهماسب، وكان القطيفي على خلافه.

فألّف المحقّق كتابه «قاطعة اللجاج في تحقيق الخراج» عام 916هـ، رتّبه على مقدّمة في أقسام الاَرضين وخمس مقالات، وقد طبعت مع الرسائل الرضاعيات.

ونقضها الشيخ إبراهيم القطيفي بكتاب أسماه «السراج الوهّاج لدفع عجاج قاطعة اللجاج».

وصارت المسألة موضع نقاش حاد بين العلماء، فألّف المحقّق الاَردبيلي رسالة دافع فيها عن القطيفي، كما ألّف ماجد الشيباني رسالة دافع فيها عن