ومن رواة النص عليه من أبيه : إسماعيل بن محمد بن عبد الله بن علي بن الحسين وزيد بن علي ، وعيسى عن جده ، والحسين بن أبي العلاء .
ولما حضرت زين العابدين الوفاة قال : يا محمد احمل هذا الصندوق . فلما توفي جاء اخوته يدعون فيه ، فقال الباقر : والله ما لكم فيه شئ ولو كان لكم شئ لما دفعه إلي وكان في الصندوق سلاح رسول الله صلى الله عليه وآله .
والذي يدل على إمامته ما ثبت من وجوب الإمامة وكون الامام معصوما ومنصوصا عليه وان الحق لا يخرج من بين الأمة . وفي النكت : ان الأصول خمسة والأشباح خمسة ، والصلوات خمس ، والعبادات خمس ، والحمد خمس ، والأصابع خمس ، والأسابيع ( خمسة ) ، والحواس خمسة ، وعلم التصريف مبني على خمس زيادة وحذف وتغيير بحركة وسكون وابدال وادغام ، والباقر خامس الأئمة ، وميزان محمد الباقر الحساب هو : جواد زاهد معصوم لاستوائهما في أربعمائة وست وعشرين قال أبو نواس :
فهو الذي قدم الله العلي له * ان لا يكون له في فضله اثان فهو الذي امتحن الله القلوب به * عما تجمجمن من كفر وايمان وان قوما رجوا ابطال حقكم * أمسوا من الله في سخط وعصيان لن يدفعوا حقكم إلا بدفعهم * ما انزل الله من آي وقرآن فقلدوها لأهل البيت انهم * صنو النبي وأنتم غير صنوان وقال منصور :
وما أخل وصي الأوصياء به * محمد بن علي نوره الصدع ذرية بعضها من بعض اصطنعت * فالحق ما صنعوا والحق ما شرعوا يا ابن الأئمة من بعد النبي ويا * ابن الأوصياء أقر الناس أم دفعوا ان الخلافة كانت إرث والدكم * من دون تيم وعفو الله متسع وقال أبو هريرة :
أبا جعفر أنت الامام أحبه * وارضى الذي ترضى وأتابع اتانا رجال يحملون عليكم * أحاديث قد ضافت بهن الأضالع وقال الحميري :
وإذا وصلت بحبل آل محمد * حبل المودة منك فابلغ وازدد بمطهر لمطهرين أبوة * نالوا العلى ومكارم لم تنفد