الجزء الثاني: يتحدث فيه ابن طفيل عن تربية حيّ و عن المعرفة الاولى التي اكتسبها عن طريق الملاحظة الحسيّة و التجربة- و ذلك عند ما بلغ سبعة اعوام.

يذكر ابن طفيل هنا كيف تظهر قوى النفس تدريجيا، من تذكر، و قوة الملاحظة، و المقارنة. و يذكر بعض التجارب التي يقوم بها في ميدان التشريح:

يعثر على مختلف اعضاء الجسم، و لا سيما الرئة و القلب. و يميز بين الجسم و بين ما يحرّك الجسم.

- ثم يقلد حي الطير في دفن جثة الميت.

- يكتشف النار و يستخدمها في الاضاءة و التدفئة، و يلاحظ خصائصها، و لا سيما اتجاهها دائما و ابدا الى اعلى.

- يتساءل عمّا اذا كان ما يحرك الجسم هو من طبيعة النار، و يلجأ الى التجربة ليتحقق من ذلك.

- يستنتج وجود روح حيواني في الجسم، هذا الروح يوحد بين مختلف اجزاء الجسم.

- يرتدي حيّ جلود الحيوانات، بعد ما كان يرتدي اوراق الاشجار و ريش الطيور.

- يستألف بعض الطيور و الحيوانات و يستخدمها.

- كان ذلك كله، و بلغ حيّ واحدا و عشرين عاما.

الجزء الثالث: حيّ يرتقي من المعرفة عن طريق الحواس و التجربة الى المعرفة العقلية القائمة على الاستنتاج من التجربة التي يجريها في عالم الكون و الفساد:

- يميز في الكائنات بين الهيولى و الصورة: يستنتج ان جميع الكائنات تشترك في شي‌ء واحد- و هو المادة- و الاختلاف يكون في الصور، اي فيما يمنح الكائن طبيعة خاصة به.

- ثم يلاحظ حيّ ان الاجسام تنقسم الى ما هو ثقيل و ما هو خفيف.

- ادرك ان الامتداد معنى زائد على الجسمية، و لا يوجد جسم الا و له امتداد.

- ادرك ان كل ظاهرة و كل حادث له علة احدثته.

- و انتهى حيّ الى ان هناك علة اولى اصل جميع العلل.

الجزء الرابع: يرتقي حيّ من تفكيره في عالم الكون و الفساد الى التأمل في السماء و العالم بأسره:

- ففي السماء اجسام كروية متناهية- و يأتي حيّ بالبرهان الرياضي ليثبت ذلك.