مراتب عالى علمى حاكى از مدارج كمالات نفسانى وى نيز مىباشد. در اينجا برخى از آثار مشهور ايشان آورده مىشود:
1- اثبات الانوار الالهيه.
2- جامع عباسى (در علم فقه).
3- اسرار البلاغه.
4- رساله اسطرلاب.
5- التهذيب يا تهذيب البيان (در علم نحو).
6- حدائق الصالحين فى شرح صحيفة سيد الساجدين 7.
7- زبدة الاصول.
8- شرح الاربعين با الاربعون حديثا كه به اربعين بهايى معروف است.
9- كشكول.
10- العروة الوثقى در تفسير سوره حمد.
11- المخلاة.
12- مفتاح الفلاح فى عمل اليوم و اليلة.
13- الوجيزة فى الدراية.
14- سوانح سفر الحجاز.
15- الحبل المتين فى احكام الدين.
16- خلاصة الحساب.
17- تشريح الافلاك.
18- الاثنى عشريات الخمس فى الطهارة و الصلوة و الزكوة و الصوم و الحج.
19- بحر الحساب.
20- رسالة الكر.
21- توشيح المقاصد يا توضيح المقاصد.
22- الفوائد الصمدية.
23- تضاريس الارض.
24- ديوان اشعار.