ولد«الشيخ محيي الدين»في النجف الأشرف في شهر صفر 1340 أو 1341 [1].
نشأ برعاية والده نشأته الأولى،و ربّي في مهد العلم و المرجعيّة تربية صالحة،و لكن والده الكريم توفّي سنة 1351 و هو لم يزل في سن المراهقة، فأولته والدته عنايتها الفائقة في تنشئته و تحبيذ الفضائل و الفواضل إلى نفسه، إذ كانت من بيت فضل و علم و مرجعية(آل الخليلي)،الأسرة النجفية الّتي طبقت شهرتها في عالم العلم و الأدب و الطب،برز منها رجال معروفون كانوا مفخرة حوزة النجف الدينيّة،و لهم آثار معروفة مشهودة،و ذكروا في كتب التراجم و التواريخ بكلّ إجلال و تكريم.
تعلم القراءة و الكتابة-كما كان يتعلّمها الناشئة في ذلك العصر-عند شيوخ الكتاتيب،و يظهر من بعض ما لمسته من معاشرته تقدّمه على كثير من أقرانه في هذه الفترة،قريحة فياضة،و خط جيّد،و معرفة حسنة بالإملاء مع الالتزام بالنظم في أوقاته و أعماله.
دراساته و تدريسه:
تتلمذ الشيخ في«جامع المقدمات»على الشيخ صادق التنكابني-احد تلامذة والده-،ثمّ درس النحو و كتاب«المطول»لدى الشيخ محمّد علي